小孩睡着咳嗽可能是上呼吸道感染而引起的。孩子的抵抗力下降，遭受病毒、细菌、支原体或是衣原体的入侵，会出现充血、水肿和炎性物质渗出的现象。孩子睡着时身体处于平卧状态，气道的分泌物向上反流，对咽喉部位产生刺激，容易出现咳嗽现象。小孩睡着咳嗽也可能是反流性食管炎而导致的。患儿的抗反流功能下降，食管粘膜的防御机制减弱，胃内容物很容易出现反流现象，导致孩子咳嗽。