肾囊肿是不会自行消失的。一般情况下较小的肾囊肿，对大部分的患者日常生活造成不适影响，只需要定期到医院进行相应的检查，观察囊肿的生长情况。若囊肿的直径大于五公分时就需要采取手术进行治疗，因为较大的囊肿会对肾脏产生不同程度的压迫，导致患者发生身体不适情况，同时较大的肾囊肿存在一定的不可控制性，可能会出现自发性的破裂，导致患者的病情越加严重。所以若因为囊肿出现身体不适的状况，需要及时就医治疗。