新生儿甲减一般是不能根治的，但是能够通过积极的治疗控制病情，患儿需要在医生的指导下积极进行甲状腺激素替代治疗，并且需要定期进行甲状腺功能的检查，及时调整药物的使用剂量，将患儿的甲状腺功能维持在正常的范围之内，以免由于甲状腺功能的异常引起生长发育迟缓、智力障碍等不良的表现。在确诊为新生儿甲减后，患儿一般需要终身用药治疗。