一般情况下，进行核磁共振检查不会对人体有影响，因为核磁共振是磁场成像，并没有放射性。但有一部分人群不适合进行核磁共振检查。由于金属会对磁场产生干扰，所以安装心脏起搏器的患者或是眼球内有金属异物的患者，还包括体内存留金属假体的患者等不适合进行核磁共振检查。由于不能够将监护仪或是抢救器材带入核磁共振检查室，所以为重病人也不适合做核磁共振检查。同时患有幽闭恐惧症的人群也应避免进行核磁共振检查。