hpv39阳性多久能自愈主要根据患者自身的身体状况和免疫强度决定的，大约需要半年至一年两年时间可以自愈，甚至长时间都无法自愈，因为hpv39属于高危型hpv病毒，自愈的可能性比较低，长时间的不治疗会导致宫颈癌前病变的现象出现。所以当检测出hpv39阳性时一定要积极配合治疗，首先需要进行tct检查，排除癌变，然后针对病毒使用抗病毒药物进行治疗，如果伴有疣状物则可以使用细胞毒性的药物或激光、冷冻等方法去除疣体。