胃窦隆起可能是慢性胃炎导致局部的胃黏膜充血水肿发生炎性增生引起；也可能是胃内肿瘤引起，例如胃窦腺瘤样息肉、胃窦癌、胃神经内分泌肿瘤等；也可能是脂肪瘤以及血管瘤、胃窦间质瘤等黏膜下病变所引起，由于病变发生在胃窦部，从而导致内镜下胃窦隆起。胃窦隆起的患者需要根据病因对症使用保护胃黏膜、抑制胃酸分泌、促胃动力的药物治疗，或是进行手术切除病变部位。