婴儿的肛瘘形成绝大多数是建议手术治疗的。利用直肠纤维镜进入到肛门里面,通过监视器对内口进行微创电凝,使肛瘘的内口干结闭合,然后洗干净瘘管里面的脓液,这样大便后,里面的细菌无法进入周围的组织,从而阻断感染源头使之痊愈。轻微症状婴儿可以在温水中进行坐浴治疗，也可以涂抹抗感染药物进行治疗。出现脓肿破溃可以用碘伏起到消毒作用。在生活中要注意局部的清洁卫生，防止造成脓肿破溃等症状。