引起孩子小孩后半夜咳嗽的原因有很多，一是呼吸道感染，呼吸道感染会导致呼吸道内分泌物增多，睡觉的时候大量的痰液聚集在呼吸道，刺激呼吸道粘膜，从而出现咳嗽的症状。二是溢奶，比较小的孩子消化系统还没有发育完全，一些有吃夜奶习惯的婴儿，吃完奶后可能会出现溢奶的情况，从而出现咳嗽的症状。三是睡眠环境差，一般下半夜温度比较低，孩子吸入冷空气也会出现咳嗽的症状。