根据患者的临床症状，可以辅助判断疾病类型，若是患有肛瘘，通常会出现肛门部位间断流脓、局部潮湿、有瘙痒感等症状。而患有疖，患者皮肤表面会出现局部红肿热痛以及小结节的症状，若是出现合并感染的现象，疖还会逐渐肿大。若是无法分辨具体的疾病类型，患者可以至医院进行肛门望诊、肛门指诊或是直肠内超声检查。除此之外，还可以进行肛周核磁共振检查，从而明确病因。