医用口罩和医用外科口罩较为明显的区别就是医用外科口罩多数是用于手术时，对于体液飞溅、血液飞溅、气液、喷射物喷溅等都有一定的阻隔效果，而且常用的医用口罩对于细菌的过滤效率达70％以上，可以很好的阻隔细菌对人体的侵害，但对颗粒物质的过滤效率有限。其次，医用口罩是比医用外科口罩生产标准更为严格的一种口罩，常见的就是N95口罩，此类口罩对于防病毒和细菌的效果比医用外科口罩更好一些，能有效的防止病毒入侵呼吸道，适用于病毒感染区的医护人员。