脖子上长扁平疣可能是因为皮肤出现细小的破损，人乳头瘤病毒趁机入侵人体，发生感染所引起的。也可能是因为与扁平疣患者近距离接触导致的，比如发生性行为或同房等都可能会感染人乳头瘤病毒，从而出现脖子上长扁平疣的现象。扁平疣患者要避免与他人发生近距离接触，防止感染他人。而且要保持良好的卫生习惯，不可以用手去抓挠患处，以免抓破引发细菌感染。