乳腺囊肿的治疗方法有：1、一般情况下，囊肿面积小于2cm以下，没有其他不适症状，可以不做处理，保证生活作息和饮食正常，禁忌使用含有雌激素的保养品等，大多数会自行消除，后期要定期复查；2、囊肿面积大于2cm以上或有炎症发生病变的患者，及时进行手术治疗，临床上采取穿刺抽吸的方法或者微创手术，以达到将囊液吸出，同时对囊液进行检查，如发现恶性情况，进行乳癌切除术等。