脚踝腱鞘囊肿确诊后可以先通过保守治疗的方法处理，可以入院请医生挤压患处，使腱鞘囊肿破裂，然后会慢慢被身体吸收，从而起到治疗效果，但这种方法治疗后病情容易反复，所以需要定期入院复查；若是与关节腔相通，囊肿难以破裂，可以通过穿刺的方法抽出囊液，然后轻轻按揉患处，再遵医嘱使用肾上腺皮质激素治疗；若是保守治疗效果不佳，建议入院通过手术的方法处理。