大拇指指甲凹陷有可能是大拇指受到外伤、营养不良、维生素缺乏、微量元素缺乏、缺铁性贫血、末梢血液循环障碍等导致的，大拇指被真菌感染引起的灰指甲也会出现大拇指凹陷的症状。建议最好去做皮肤镜检查，如果是真菌感染引起的，需要在医生的指导下用伊曲康唑、酮康唑等抗真菌的药物治疗，患者症状比较严重的时候，还要通过拔甲手术治疗。患者这段时间要多吃苹果、香蕉、牛肉、牛奶、羊肉等维生素和蛋白质含量丰富的食物。