患者发烧39度可以使用退烧药退烧，常见的有布洛芬缓释胶囊和对乙酰氨基酚片等，并且配合温水擦拭身体物理降温，能够增加机体的散热面积，能促进温度下降；也可以用干毛巾将冰块包裹着，放在腋窝、肘窝以及腹部沟等部位。如果患者发烧39度与细菌感染有关，则需在医生的指导下使用抗菌药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢呋辛钠和左氧氟沙星等，禁忌私自改变服药的剂量。