健康管理师证书分为职业技能等级证书和岗位能力证书两种，职业技能等级证书是由人社部的下属机构发放的，而岗位能力证书则是由中国国家人事人才培训网和中国医药教育协会联合认证的，目前，卫健委组织的考试发证已经改为职业技能等级证书了。

健康管理师共分为五个等级，一级健康管理师的等级最高，五级健康管理师的等级最低，但是目前只开放三级健康管理师的考试。