营养指导员资格证报考流程如下：

1、满足以下条件之一的人员均可报考：已在各省(区、市)完成营养指导员培训并通过专业技能考试的人员；已取得卫生专业技术资格的人员；食品、营养相关专业中专及以上学历毕业的人员；注册营养师、注册营养技师(通过了中国营养学会组织的注册营养师水平评价考试，并完成备案注册)。

2、按照所在省份相关要求在规定时间内完成考试报名。

3、参加远程在线考试，考试题型为单项选择题，总题量为80道题，考试时长90分钟。