中医针灸师证书的考试内容包括中医针灸的基本理论、基本技能、穴位应用、针灸治疗方法等方面，以及相关法律法规和职业道德规范。

具体来说，中医针灸师证书考试科目包括中医基础理论和针灸学，中医基础理论主要考查考生对中医基础理论、经络学、诊断学等方面的掌握程度；针灸学主要考查考生对针灸学基础知识、常用穴位、常见病的诊断和治疗等方面的掌握程度。