运动康复师证发证机构主要包括以下几个部门：

1、国家卫生健康委员会：作为中国最高卫生健康行政管理机构，国家卫生健康委员会负责制定和发布运动康复师相关政策、标准和规范，在运动康复师证书的发放和管理方面，国家卫生健康委员会具有权威性和决定性作用。

2、国家体育总局：国家体育总局是中国体育事业的最高领导机构，负责制定和实施体育发展规划、政策和法规，在运动康复师培训和证书颁发方面，国家体育总局也发挥着重要作用。

3、中国康复医学会：中国康复医学会是一个专业性、学术性和群众性相结合的全国性社会团体，致力于推动康复医学的发展和应用，该学会负责组织和监督运动康复师的培训、考试和证书颁发工作，确保运动康复师的专业水平和素质。

4、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在国家和地方层面分别负责本行政区域内的卫生健康工作，在运动康复师证书的发放和管理方面，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会也需要遵循国家和地方的相关政策和规定。

5、职业培训机构：为了培养更多的运动康复师，各级职业培训机构也会开设相关的课程和培训班，这些培训机构在运动康复师证书的发放中起到桥梁作用，将学员的学习成果反馈给相关部门，以便顺利颁发证书。

6、企事业单位：一些企事业单位如医院、体育中心等需要招聘或自建运动康复师团队，这些单位可以通过与职业培训机构合作，或者自行组织培训考试的方式，发放运动康复师证书。

7、国际组织：随着全球交流与合作的不断加深，一些国际组织也开始关注和参与运动康复师的发展，世界卫生组织(WHO)等国际组织可能会对运动康复师的培训和证书颁发提供指导和支持。

运动康复师证发证机构主要包括国家卫生健康委员会、国家体育总局、中国康复医学会等政府部门，以及各级职业培训机构、企事业单位等，这些部门共同参与和管理运动康复师证书的发放工作，确保运动康复师的专业水平和素质得到保障，运动康复师证书具有较高的权威性和认可度，对于从事运动康复工作的人员来说，具备这样的证书是提高自身竞争力和职业发展的重要途径，这也是对广大患者和社会公众负责任的表现，有助于推动运动康复事业的健康发展。