康复理疗师证发证机关是指负责颁发康复理疗师资格证书的政府部门或机构，在中国，康复理疗师证书由国家卫生健康委员会颁发，具体操作需要在指定的报名网站进行。

填写康复理疗师证发证机关时，需要根据自己的实际情况选择相应的单位，康复理疗师可以在医院、康复中心、养老院等医疗机构从事康复治疗工作，也可以在学校、体育队等其他机构开展康复训练工作，在填写时需要根据自己的工作经历和所在单位进行选择。

如果您是第一次申请康复理疗师证书，可以先了解一下国家卫生健康委员会的官方网站，了解相关的报名流程和要求，也可以咨询一些已经获得康复理疗师证书的人，了解他们的经验和建议。

填写康复理疗师证发证机关时需要认真仔细，确保所填写的信息准确无误，也需要提前做好准备工作，包括学习相关知识、参加培训课程、积累实践经验等，以提高自己的专业水平和竞争力。