碘伏不可以治疗扁平疣。扁平疣是由于皮肤感染人乳头瘤病毒引起的疾病，患者需要进行抗病毒治疗，可以遵医嘱使用水杨酸、维A酸、干扰素、咪喹莫特、氟尿嘧啶等药物涂抹治疗；患者也可以增加使用西咪替丁、卡介菌多糖核酸注射液等药物。碘伏具有广谱杀菌的效果，常用于皮肤、黏膜等部位的消毒；也可以治疗滴虫性阴道炎、皮肤霉菌感染等疾病，但是碘伏无法杀灭人乳头瘤病毒。