两边肩胛骨疼痛考虑三方面因素引起：第一、平时坐姿不良或者局部受凉等引起胸背肌筋膜炎所致。因为长期不良姿势会牵拉肌肉和筋膜，容易产生无菌性炎症，导致肩胛骨出现疼痛。第二、也不排除是患有颈椎病、肩胛提肌综合征等相关疾病引起。第三、如果患有心绞痛、心肌梗死、胆囊或者肝脏等相关疾病，也会引起肩胛骨疼痛。建议及时就诊，通过详细检查明确诊断。