系统性红斑狼疮主要检查项目有免疫球蛋白、尿蛋白、尿常规、肾功能、肝功能、尿常规、血常规、抗核抗体和自身抗体等检查。还有神经系统检查以及其他检查，比如心电图、B超、胸片、核磁共振、心功能等。还可能需要做肾穿刺病理学检查或者皮肤活检病理学的检查。其中抗核抗体谱是系统红斑狼疮检查的重要部分，抗核抗体谱中的抗双链DNA、抗smd1抗体、抗核小体抗体是系统性红斑狼疮诊断的标志抗体。