在检查出回肠末端溃疡后首先是需要调整好饮食习惯，避免食用刺激性的食物，要以清淡有营养为主，此外还可以遵医嘱食用胃粘膜保护剂、胃酸抑制剂以及消炎药物等进行治疗。还有就是可以根据引发回肠末端溃疡的病因进行治疗，如克罗恩病导致的可以使用氨基水杨酸制剂、糖皮质激素等进行治疗，若是病情严重就考虑进行手术治疗了，若是肠结核引起的可以食用链霉素、异烟肼等药物进行治疗。