肠镜属于是一种侵入式的检查，对人体的肠道确实会有一定的伤害。如果在不正规的医院做肠镜检查，可能会出现肠道内的感染或者是肠粘膜损伤等危害；但是只要选择正规的医院进行肠镜检查，对身体的危害还是比较小的。目前在临床上，肠镜是针对结肠以及直肠内的疾病一种很好的检查方式。因为做肠镜可能会产生一定的痛苦，所以如果不能耐受的患者，也可以选择做无痛肠镜，通过注射麻药减轻肠镜检查的痛苦。