指甲盖凹凸不平有小坑首先考虑是指甲有过外伤，造成指甲盖向内凹陷导致的，是正常的现象，等到指甲慢慢生长，向上延伸，小坑就会慢慢消失。其次，如果指甲营养不良的话，也会导致指甲盖凹凸不平有小坑，患者饮食要均衡，富有营养，不能偏食、挑食。另外，如果有真菌感染的话，例如灰指甲等，也会导致指甲盖凹凸不平有小坑，患者可以服用抗真菌的药物或者是涂抹抗真菌的药膏进行治疗。