肝穿刺本身就属于一种有创性的检查操作。肝脏穿刺后可能会出现肝脏出血、胆漏，但是一般经过段时间恢复会逐渐停止。也有部分患者会出现严重出血，引起失血性休克或者受到感染，引起胆汁性腹膜炎。肝穿刺也可能会损伤肝脏周围的器官，例如损伤胃、肠道，出现消化道瘘。如果患有肝癌，做肝穿可能会导致肝癌肿瘤细胞扩散，出现转移，影响患者生存时间。而且肝脏穿刺时会进行麻醉，可能会导致心慌、心悸，心率异常等症状。