治疗肠炎首先应该查找病因，针对病因进行治疗。如果是细菌性肠炎需要根据药物敏感试验来选择合适的抗生素治疗如庆大霉素、红霉素、卡那霉素等，如果是阿米巴痢疾、滴虫引起的肠炎，可以使用甲硝唑，白色念珠菌肠炎口服制霉菌素药物治疗。给予抑制肠道蠕动的药物如阿托品、颠茄等，可以减轻患者腹泻、腹痛的症状。如果肠炎合并肠穿孔、肠梗阻等，保守治疗无效的患者，应进行手术治疗。