临床上用于治疗丝状疣的药膏有水杨酸、3%酞丁胺霜、5-氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特乳膏、喷昔洛韦乳膏、维A酸软膏、五妙水仙膏等等，均可以用于治疗丝状疣，另外部分患者在没有治疗的情况下丝状疣可以自行消退，其次丝状疣具有一定的复发性，也有少数情况会出现恶变的可能性。除了外用药物以外，还可以局部注射普鲁卡因，或是进行手术治疗，对于症状较轻的患者还可以通过冷冻疗法、电灼术和激光进行治疗。