冬瓜籽的常见功效有清热解毒、润肺清肺、止咳化痰、排脓利湿、消肿利尿等。可以用来治疗肺脓疡、痰热咳嗽、水肿、咽喉肿痛等病症。冬瓜籽对高血压的患者，也有一定的食疗作用。此外男子白浊、女子白带以及湿气过重引发的单纯性肥胖，适当的用些冬瓜籽，也有不错的治疗效果。冬瓜籽还含有不饱和脂肪酸，可以减少血液中的脂肪以及胆固醇的含量，从而有防治心血管病的效果。