卵巢囊肿透声差是否严重，需要根据病情来判断。如果是滤泡囊肿或者是黄体囊肿引起的，通常是卵子在排出后，卵泡液淤积在卵泡囊内而形成的生理性囊肿，一般在经期过后就会自行消失，不属于严重的情况。如果是急性盆腔炎引起的，而且伴有剧烈的腹痛，属于比较严重的情况。如果是卵巢巧克力囊肿引起的，可能会伴有进行性加重的疼痛，属于比较严重的情况。如果是病理因素引起的，建议患者及时就医，对症治疗。