慢性结肠炎主要以药物治疗为主，需要对症进行治疗，患者出现腹泻的现象时，需要使用蒙脱石散药物来减少肠道蠕动，缓解腹泻。腹胀的时候要使用莫沙必利或者伊托必利等药物来治疗。如果确诊为慢性溃疡性结肠炎，应使用柳氮磺胺吡啶以及美沙拉嗪药物来治疗。慢性结肠炎患者腹泻较为严重时，会导致脱水，此时需要及时补液来纠正酸碱平衡失调。出现肠梗阻等并发症，必要时需手术治疗。