月经刚结束两天不一定会怀孕。一般来说，排卵日在下次月经来潮前的第14天，女性月经刚结束时并没有成熟的卵泡排出，同房无法受精形成受精卵造成怀孕。但是，排卵容易受到女性情绪、营养水平以及内分泌等多种因素影响，而且月经周期长短也会因人而异，所以月经两天后虽然几率比较低，但也有可能会出现排卵，造成怀孕，建议未做好怀孕准备时要做好保护措施，不确定是否怀孕要及时就医进行检查。