细菌性阴道炎与霉菌性阴道炎最主要的区别是感染性质不同。一般细菌性阴道炎是由大肠杆菌或者其他类型的厌氧菌感染引起，而霉菌性阴道炎是有白色念球菌感染引起。而细菌性通常会使阴道分泌物增多，并且呈现为黄色，同时会伴有瘙痒以及异味，阴道局部还会有灼热感。而霉菌性感染会导致阴道分泌物呈现为豆腐渣样，同样也会导致外阴瘙痒，比较严重的患者会感到疼痛，排尿时也会有一定的疼痛感。