巧克力囊肿在临床妇科属于比较常见的疾病，主要是指异位子宫内膜在卵巢内生长，形成囊肿，这种疾病是会影响女性的生殖功能的，而且女性怀孕的几率不是很大，一般在百分之五左右，主要是因为囊肿的原因会导致卵巢输卵管局部发生粘连，进而会影响受精卵的着床。因此对于巧克力囊肿的患者如果想要打算备孕，建议最好去医院妇产科进行相关的辅助检查，如果发现囊肿的直径超过5厘米以上，这时候可以行手术切除治疗。