如果是单纯性肝囊肿考虑是胚胎发育时组织结构发育异常导致的或者是胆管周围腺体异常导致；如果是多囊性肝病多考虑是家族遗传、染色体变异导致；如果是肝包虫囊肿多考虑是因为感染细粒棘球绦虫的幼虫或多房棘球绦虫的幼虫引起。临床上对于单纯性肝囊肿不需要进行特殊治疗，定期复查检测即可；对于多囊性肝病可以通过使用生长抑素类似物抑制囊肿的生长或者通过手术处理；对于肝包虫囊肿可以使用苯并吡唑类化合物治疗。