运动后头痛的原因有以下几种。1、剧烈运动后，您的体内产生大量的乳酸，导致神经递质紊乱，从而引起短暂的头痛，一般休息一段时间后，疼痛会消失。2、自身患有高血压等疾病，血压没有控制好，在运动后，血压上升，引起疼痛。3、运动前未进食，在运动后出现低血糖，从而造成头痛。4、运动过于剧烈，头部缺氧、或者是发生脑血管扩张、脑血管痉挛所致。5、患有脑梗塞、脑血栓、脑部肿瘤等疾病造成。