小儿高烧40度时需要先入院进行血常规检查以及C反应蛋白检查来诊断病因，如果确诊为细菌感染所致，需要遵医嘱使用抗生素药物来治疗，比如青霉素、头孢菌素等，同时还需要联合使用布洛芬混悬液或者乙酰氨基酚等药物来降温。药物降温的同时还可以进行物理降温治疗，使用温水毛巾进行全身擦拭，还可以用毛巾包裹冰袋，将其放置于腋下、腹股沟等部位，从而加快体内热量的散发。