灰指甲的根除是十分困难的，因真菌生长速度较快常导致病情的反复。临床上针对甲癣患者，一般根据口服药为主，外用药为辅的治疗原则进行病甲的对症处理。口服药一般选用抗真菌药物抑制真菌的生长繁殖，加强患者自身机体的新陈代谢。常见的口服药物有伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等。外用药物常选用环吡酮胺软膏等。灰指甲虽然很难得到彻底根治，但患者积极配合用药，往往预后较好。