嘴苦口臭有可能是有口腔类的疾病引起，如龋齿、残根残冠、牙根尖炎或是牙龈炎等，因为牙齿缺损部位有大量的食物残渣和菌斑，一起发酵产生硫化氢以及氨类物质，引起嘴苦口臭。还有可能是胆囊功能异常或是不足，多是由胆囊疾病，如胆囊炎或是胆结石等引起的嘴苦口臭。另外，患有消化系统疾病，比如胃肠道蠕动不足、胃炎以及胆汁反流至胃等，还有慢性上颌窦炎，也会引起嘴苦口臭。