跖疣可以使用维A酸乳膏、5%氟尿嘧啶软膏、重组人干扰素α2b软膏、5%咪喹莫特乳膏、3%酞丁胺二甲基亚砜溶液、3%酞丁胺霜等药物进行治疗，部分药物具有一定的刺激性，需要遵医嘱使用。如果有炎症感染的情况，还需要给予抗生素软膏治疗，常用的药物有克林霉素磷酸酯凝胶、夫西地酸软膏、红霉素软膏等。如果症状持续不能缓解的患者可以通过冷冻、电灼、微波等物理方式治疗。