三个月的宝宝咳嗽首先考虑是宝宝年龄太小，胃是横胃，幽门较紧，但贲门比较松弛，此种情况很容易引起胃食管反流，从而导致呛咳；其次考虑是呼吸道感染引起的咳嗽，如果宝宝咳嗽的同时伴有发热的现象，通常是由于感染性疾病所造成的，若咳嗽的时候伴有喘气，考虑是过敏性哮喘的可能性比较大；另外也不排除是吸入性肺炎所引起的咳嗽。因此，建议家长最好是能够带宝宝前往医院就诊，明确病因，对症治疗。