诊断肠结核的标准有：1、肠结核患者会出现右下腹部的钝痛或者隐痛感，可能会在进食之后加重，也可能会出现右下腹部的肿块，按压时疼痛剧烈。肠结核的患者还可能会伴随恶心呕吐等胃肠不适症状；2、诊断肠结核还要结合X线检查，患者的肺内部一般都会存在活动性结核或者陈旧性结核病灶；3、进行病理活检，检测组织中存在结核杆菌、干酪样坏死性肉芽组织。若是满足以上标准，则基本可以判断为肠结核。