眼窝疼有可能是过度用眼导致眼睛疲劳引起，比如经常熬夜、长时间使用电子产品等，也可能是眼部病变引起，比如角膜炎、结膜炎、青光眼、高眼压症、沙眼、角膜溃疡、睑板腺囊肿、霰粒肿等疾病，建议您入院进行眼底检查以及眼部分泌物检查。如果确诊为结膜炎，则可能是微生物感染、免疫病变、邻近器官蔓延感染以及眼部肿瘤等因素引起，细菌性结膜炎需要使用左氧氟沙星或者妥布霉素滴眼液进行治疗。