心理咨询师证书发证机构是指负责颁发心理咨询师资格证书的政府部门或专门的培训机构，在中国，心理咨询师证书发证机构主要由以下几个部门负责办理业务：

1、人力资源和社会保障部(原劳动和社会保障部):人力资源和社会保障部是中华人民共和国国务院组成部门之一，负责制定和实施国家职业资格证书制度，根据《职业技能鉴定条例》和相关规定，人力资源和社会保障部负责心理咨询师职业资格的认证工作，包括考试、培训、证书颁发等。

2、中国心理学会：中国心理学会(Chinese Psychological Association,简称CPA)是中国最具权威性和专业性的心理学学术组织，成立于1953年，中国心理学会负责组织和开展心理咨询师的专业培训和考核工作，对参加培训并通过考核的人员进行资格认证，颁发心理咨询师资格证书。

3、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局):各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局)在人力资源和社会保障部的指导下，负责本地区的心理咨询师职业资格认证工作，各级人社厅(局)设立职业技能鉴定中心，负责组织心理咨询师职业资格培训、考试、证书颁发等工作。

4、各地心理咨询师培训机构：各地设有专门从事心理咨询师培训的机构，如新东方、北大心学堂等，这些培训机构为有志于从事心理咨询工作的人员提供专业的培训课程和实践机会，帮助学员掌握心理咨询师所需的专业知识和技能，学员完成培训后，可参加由中国心理学会组织的心理咨询师职业资格鉴定考试，通过考试的人员可获得心理咨询师资格证书。

5、其他相关社会组织：还有一些其他社会组织参与到心理咨询师证书发证机构的工作中，如中国心理卫生协会、中国婚姻家庭咨询学会等，这些组织开展心理咨询师的专业培训、学术研究和咨询服务，为推动心理咨询行业的发展做出贡献。

心理咨询师证书发证机构涉及多个部门和机构，包括政府部门、学术组织、培训机构等，这些部门和机构共同协作，确保心理咨询师职业资格认证工作的顺利进行，为广大需要心理咨询服务的人们提供专业、高效的服务。