健康管理师证的颁发部门是指负责管理和监督健康管理师职业资格认证的政府部门或机构，在中国，健康管理师证的颁发部门主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会共同负责。

国家卫生健康委员会作为国务院直属事业单位，负责制定和发布卫生健康行业的政策法规，对全国卫生健康工作进行指导和监督，国家卫生健康委员会下设多个司局，其中包括人事司、职业卫生与放射卫生司等，这些司局在健康管理师职业资格认证方面发挥着重要作用。

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会则是在国家卫生健康委员会的指导下，负责本行政区域内的卫生健康工作，各级卫生健康委员会根据国家卫生健康委员会的政策法规，制定本地区的卫生健康政策和标准，组织实施健康管理师职业资格认证工作。

除了国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会外，还有一些其他部门和机构也参与到健康管理师证的颁发工作中，中国职业技能鉴定指导中心(原劳动部职业技能鉴定中心)是负责组织和管理全国职业技能鉴定工作的国家级机构，其在健康管理师职业资格认证方面也承担着重要职责。

一些行业协会和专业组织也在健康管理师证的颁发工作中发挥着作用，中国健康促进会、中国保健协会等组织通过组织培训、推广宣传等方式，为健康管理师提供专业知识和技能的支持，帮助广大健康管理者提高自身素质和能力。

健康管理师证的颁发部门是一个涉及多个政府部门、机构和行业协会的复杂体系，在这个体系中，国家卫生健康委员会和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会起到了核心作用，负责制定政策法规、监督管理和组织实施健康管理师职业资格认证工作，其他相关部门和机构也在各自领域内为健康管理师证的颁发提供了支持和保障。