健康管理师证书是由多个机构颁发的，其中包括中国卫生部、国家卫生健康委员会、人力资源和社会保障部等，在中国，健康管理师证书的颁发主要由以下几个机构负责：

1、中国卫生部

中国卫生部是中国政府主管卫生事业的部门，负责制定和实施卫生政策、法规和标准，根据《中华人民共和国职业资格证书条例》，卫生部负责对健康管理师职业资格进行认证和管理，获得健康管理师证书的人需要通过卫生部组织的考试和审核。

2、国家卫生健康委员会

国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门之一，负责全国卫生健康工作，该委员会下设多个部门，如保健局、医政医管局等，这些部门都参与到健康管理师证书的颁发工作中，保健局会组织相关培训和考试，而医政医管局则会对考试成绩进行审核和认证。

3、人力资源和社会保障部

人力资源和社会保障部是中华人民共和国国务院组成部门之一，主要负责人力资源和社会保障工作的管理和监督，该部门下设多个司局，如劳动保障司、人力资源市场司等，这些司局也会参与到健康管理师证书的颁发工作中，人力资源市场司会负责制定相关政策和标准，以确保健康管理师证书的权威性和有效性。

4、其他专业机构和行业协会

除了以上几个主要机构外，还有一些专业机构和行业协会也颁发健康管理师证书，中国保健协会、中国医学科学院健康管理中心等，这些机构通常会与政府部门合作，共同制定培训课程和考试标准，并对学员进行培训和考核，获得这些机构颁发的健康管理师证书同样具有一定的权威性和认可度。

在中国，健康管理师证书的颁发涉及多个部门和机构，包括政府部门、专业机构和行业协会等，这些机构共同制定了培训课程、考试标准和认证流程，以确保健康管理师证书的质量和权威性，想要获得健康管理师证书的人需要参加相关培训和考试，并通过多个机构的审核和认证。