在经营营养品公司的过程中，需要办理的证件和手续主要包括以下几个方面：

1、企业注册登记：需要在工商行政管理部门进行企业注册登记，取得营业执照，企业注册登记需要提供公司名称、注册资本、经营范围、股东信息等相关信息，在注册过程中，还需要按照相关规定提交相关证明材料，如身份证明、场地租赁合同、税务登记证等。

2、食品经营许可证：营养品属于食品范畴，因此需要办理食品经营许可证，食品经营许可证是由国家市场监督管理总局颁发的，用于规范食品生产经营活动，保障食品安全，办理食品经营许可证需要提供企业营业执照、食品安全管理制度、从业人员健康证明等相关材料。

3、产品质量检验合格证：营养品公司生产的产品需要符合相关的产品质量标准，因此需要办理产品质量检验合格证，产品质量检验合格证是由省级以上质量技术监督局颁发的，用于证明产品符合国家或行业规定的质量要求，办理产品质量检验合格证需要提供产品样品、产品质量检测报告等相关材料。

4、药品经营许可证(如果涉及药品类营养品):如果营养品公司生产的营养品含有药品成分，那么还需要办理药品经营许可证，药品经营许可证是由国家药品监督管理局颁发的，用于规范药品经营活动，保障药品安全，办理药品经营许可证需要提供企业营业执照、药品经营质量管理规范、药品经营场所等相关材料。

5、医疗器械生产许可证(如果涉及医疗器械类营养品):如果营养品公司生产的营养品涉及医疗器械类产品，那么还需要办理医疗器械生产许可证，医疗器械生产许可证是由国家药品监督管理局颁发的，用于规范医疗器械生产活动，保障医疗器械安全，办理医疗器械生产许可证需要提供企业营业执照、医疗器械生产质量管理规范、医疗器械生产场所等相关材料。

6、知识产权保护：为了保护企业的知识产权，防止侵权行为，营养品公司还需要申请商标注册、专利申请等，商标注册可以保护企业的品牌形象，专利申请可以保护企业的技术创新成果。

7、环境影响评价：营养品公司在生产过程中可能对环境产生一定影响，因此需要进行环境影响评价，环境影响评价是为了评估企业在生产经营活动中对环境的影响程度，并采取相应的措施减轻或消除不良影响，办理环境影响评价需要提供企业基本信息、生产工艺流程、环境保护设施等相关材料。

8、其他相关证照：根据具体情况，营养品公司还需要办理其他相关证照，如消防安全验收、职业卫生安全验收等。

营养品公司在办理各类证件和手续时，需要遵循国家和地方政府的相关规定，确保合法合规经营，还需关注行业动态，及时了解政策变化，为企业的发展提供有力支持。